MACS2 este un instrument de analiză pe baza modelului de date-Chip Seq.
Odată cu îmbunătățirea tehnicilor de secvențiere, cromatinei imunoprecipitare urmată de secvențiere high-throughput (Chip-Seq) devine popular pentru a studia interactiunile de proteine-ADN-genomului. Pentru a rezolva problema lipsei de puternic metodei de analiză-CHIP Seq, vom prezenta un algoritm roman, pe nume Analiza Modelul bazat pe chip-Seq (MACS), pentru identificarea site-uri de legare factor de transcriere. MACS surprinde influența complexitate genomului pentru a evalua importanța regiunilor ChIP îmbogățite, iar MACS îmbunătățește rezoluția spațială a siturilor de legare prin combinarea informațiilor de atât poziția tag secvențiere și orientare. . MACS poate fi ușor de utilizat pentru datele chip Seq singur, sau cu proba de control cu creșterea de specificitate
Cerințe :
- Python
Comentariile nu a fost găsit