MISO (Amestec de Izoforme) este un cadru probabilistic scris în Python care cuantifică nivelul de expresie & nbsp; de gene alternativ racordate la date ARN Seq, și identifică izoforme diferențiat reglementate sau exoni peste probe.
Prin modelarea procesului generativ prin care citește sunt produse din izoforme din ARN-Seq, modelul MISO folosește inferență Bayesian pentru a calcula probabilitatea ca o citire provenit de la un anumit izoformă.
MISO folosește atribuirea dedus de citește izoforme pentru a cuantifica abundența setului de bază de izoforme alternative de ARNm. Intervale de încredere peste estimări pot fi obținute, care cuantifică Fiabilitatea estimărilor.
Vă rugăm să consultați http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ pentru manual și documentația MISO
Cerințe :.
- Python
Comentariile nu a fost găsit