MacMolPlt

MacMolPlt este un instrument de vizualizare chimie care poate fi folosit pentru a construi molecule cu un model de constructor grafic integrat, creați fișiere de intrare pentru programul chimie computațională GAMESS, iar apoi vizualizarea rezultatelor ruleaza chimie computaționale. Caracteristicile includ un ecran 3D de înaltă calitate, animații ale modurilor normale și secvențe de reacție și de ieșire la o varietate de formate, inclusiv imagini de înaltă calitate și QuickTime și Flash filme.

• Input folosind:
• format de fișier MolPlt lovit de GAMESS
• de lipire în coordonate carteziene de la orice GAMESS sau Gaussian fișier log
• orice intrare GAMESS, jurnal sau fișier IRC
• Xmol fișier stil XYZ
• Molden fișiere în format
• Protein Data Bank (PPB ) fișier
• Chemical Markup Language (CML) fișiere
• Construiți grafic cu un editor moleculă interactiv
• Construiți manual folosind coordonatele interne de stil cartezian sau Z-Matrix
• afișare 3D a structurii și modul Normal
• Animație de moduri Normal.
• 3D rotație în timp real și traducere sub control al mouse-ului
• Calculul orice parametru Z-matrice
• măsură vizual / distante de afișare, unghiuri diedre și.
• crearea automată a liniare cel mai puțin (LLM) căi de mișcare
• calculul și afișarea 2D și 3D:
• orbitali moleculari (lui AO, lui MO, sau a lui LMO)
• Raport de electroni densitate
• diferențe Densitate
• moleculară electrostatică Potențialul (MEPMaps)
• Generator de baza fișier de intrare pentru GAMESS
• OpenGL folosi in randare 3D de înaltă calitate
• Suport pentru simetrie moleculară
• Generați simetrie atomi de întreținere
• Determinați simetrie atomi unice
• determina automat lista grupurilor de puncte sprijinite de un set de coordonate.
• Rotire coordonează în orientarea principiu propriu
• operatorilor de simetrie afișare pentru multe grupuri de puncte
• ieșire de calitate publicării (color sau alb-negru) prin imprimare directă sau Copiați și lipiți în altă aplicație.
• Ieșire într-o varietate de forme, inclusiv Windows bitmap, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, lei molfile, POV-Ray, filme Flash și filme QuickTime.

Ce este nou în această versiune:

Mai multe îmbunătățiri au fost făcute la codul de afișare. Opțiuni au fost adăugate la panoul 3D a prefernces de umbrire neted, cu și fără umbre.
Adăugat suport rudimentar pentru fișiere Mopac.
Opțiune pentru a comuta vizibilitatea ab initio, MM, iar atomii EFP Adaugata.
Suport îmbunătățit pentru modelul Core Potențialele.
Adăugat un cârlig în constructorul de intrare pentru noul program GAMESSQ.
Ameliorarea parser fișier PPB.