GENESIS (prescurtarea de la General Neural sistem de simulare) este o platformă de simulare de uz general, care a fost dezvoltat pentru a sprijini simularea sistemelor neuronale de la componente subcelulare și reacții biochimice la modele complexe de neuroni unice, simulări de rețele de mari dimensiuni și SISTEME modele de nivel.
GENESIS a oferit baza pentru cursuri de laborator în simulare neuronale la Caltech, biologice marine de laborator, Creta, Trieste, Bangalore, și scurte cursuri Obidos în Computational Neuroscience, și cel puțin 49 de universități de care suntem conștienți.
Cele mai multe aplicații GENESIS actuale implica simulari realiste de sisteme neuronale biologice. Deși software-ul poate modela, de asemenea, rețelele de mult mai abstracte, alte simulatoare sunt mult mai potrivite pentru propagare inversă și modelarea conexioniste similare.
Instalare
1. Alegeți locul în care doriți să instalați "geneza" arborele director. Dacă vi se face o instalare la nivel de sistem ca "root" utilizator, / usr / local este o alegere bună. Pentru o instalare personal, fără drepturi de root, puteți utiliza directorul tau de casa ("~"). Schimba acest director și se extrage directorul geneza din arhivă genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz. De exemplu,
cd / usr / local
tar xvzf /mnt/cdrom/genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz
sau de oriunde ai (de exemplu, ~ / downloads / genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz) au.
2. Schimbați la directorul "geneza" și rulați scriptul de configurare care creează ".simrc" dosarul inițializare GENESIS ". Apoi copiați .simrc la directorul tau de casa.
cd genesis
./binsetup
.simrc cp ~
3. Finallly, adauga directorul geneza la calea de căutare, astfel încât "geneză" poate fi găsit la orice director care vă aflați. Dacă shell de autentificare este bash, puteți face acest lucru prin editarea fișierului .bashrc in directorul tau de casa pentru a adăuga linia
PATH = $ PATH: / usr / local / geneză
la finalul fișierului. Dacă utilizați tcsh sau csh ca shell comanda, adăugați
calea set = ($ cale / usr / local / geneză)
pentru .tcsh sau fișier .csh.
În acest moment, sunteți gata să încercați să rulați GENESIS. Schimba în directorul Geneza / script-uri și încercați unele dintre tutoriale sugerate în fișierul README
Ce este nou în această versiune:.
- Numeroase bugfixes și îmbunătățiri.
Comentariile nu a fost găsit