FlexS prezice conformația și orientarea unul dintre liganzii în raport cu celălalt. În FlexS referință ligandul se presupune a fi rigid, astfel, ar trebui să se acorde o conformație care este similar cu starea de legat. Algoritmul suprapunere în FlexS nevoie doar de puțină intervenție manuală. Puteți integra aceste cunoștințe în calculele cu FlexS prin efectuarea etape unice manual. Astfel, FlexS este conceput pentru lucru interactiv pe perechi ligand, precum și pentru bazate pe ligand de screening virtuale. Cele două cereri principale de FlexS sunt poziționare foarte ligand (de exemplu. Pentru CoMFA / QSAR) și de screening virtuale. Dacă aveți o proteină și un mic legarea la o moleculă (așa numita referință-ligand), dar nu structura proteinei, puteți lua structura de referință ca o amprentă negativă a site-ului activ. FlexS determină similitudinea dintre test și structura de referință prin alinierea lor. În screening-ul virtual, ai o referință-ligand și un set de compuși și sunteți interesat în prioritizarea compușii pentru testare experimentală.
Comentariile nu a fost găsit