Arabidopsis Motif Scanner (AMS) este o aplicatie Windows care ruleaza pe computere locale. Acesta a fost dezvoltat pentru a construi retele de gene prin identificarea pozițiilor elementelor cis de reglementare din Arabidopsis thaliana modelul de plante și prin furnizarea de o interfață ușor de a evalua și de a evalua relatiile de gene. Caracteristica majoră inovatoare este de a combina pozițiile elementelor cis-reglementare, NGS și ADN-ul Chip Vectorii de date de expresie, adnotări Arabidopsis și interacțiunile gene pentru identificarea rețelelor de gene reglementate de factori de transcripție. În studiile s-au concentrat asupra functiei factori de transcriere, software-ul utilizează datele de expresie și de legare motive site-ului în regiunile genei reglatoare pentru a anticipa gene tinta directe. In plus, AMS utilizeaza date ADN-proteine și interacțiune proteinprotein pentru a facilita identificarea căilor metabolice reglementate de factor de transcriere de interes.
Comentariile nu a fost găsit