Bibliosphere Analysis Kit

BiblioSphere oferă o combinație unică de literatură, minerit și analiză cale pentru biologi moleculare interesate în reglementarea gena si retele biologice.
 BiblioSphere modalitate Edition folosește o bază de date cuprinzătoare a relațiilor modelate individual între gene, proteine, complexe, celule și țesuturi, împreună cu tehnicile miniere up-to-data de text pentru extragere automată cunoștințe pentru a vă permite pentru a lega datele la rețele biologice în diferite contexte biologice.
 Folosiți BiblioSphere la

• extinderea rețelelor biologice dincolo de informații cale canonic
• (de reglementare și metabolică) îmbina rezultatele mari tranziteaza cu cunoștințe biologice și secvență analize bazate
• efectua de context Analiza sensibil cale de reglementare
• genereaza variante cale-experiment specific
• căi de legătură la mecanisme de boala si gene
• face avansat design experimental

Ce este nou în această versiune:

noi și consolidate Surse de date

• Genomatix Expert întreținută Gene-Gene Relații:
   Genomatix a integrat de proprietate, baza de cunoștințe a datelor întreținută de experți privind reglementarea gena în BiblioSphere. Această sursă de date unică adaugă semantica relațiilor gene-gene la generate dinamic rețelele de gene BiblioSphere, furnizarea de informații cum ar fi "Gene O activeaza transcriere a genei B" sau "Gene O interactioneaza fizic cu gena B".
  
• Caile de transmitere a semnalului:
   Porțiuni de Gene Ontologie relevante pentru transmiterea semnalului, precum și date compilate din literatura de specialitate au fost combinate pentru a permite identificarea de căi canonice legate de rețeaua de concentrat.
  
• metabolice Asociații traiectorie:
   Asociații calea de metabolizare au fost integrate pentru a permite identificarea evenimentelor metabolice relevante pentru setul de gene.
  

• Calea Vezi cu experți întreținută relatii gene-gene
   Grupuri Gene sunt compilate în ușor de înțeles grafice dinamice de rețea care combină de utilaje întreținută relații genă-gene cu date provenite de la extracția automată cunoștințe. Rețelele pot fi personalizate prin filtre și sa concentrat în mod genă centrat de a efectua analize mai scurt drum.
  
• Celular Sediu Vizualizare
   Bazat pe gene GO adnotărilor sunt atribuite la poziția lor subcelular și vizualizat ca un aspect celulă cartografiat, permițându-vă să identifice regiunile subcelulare și compartimentele relevante pentru setul de gene.
  

• Management de proiect: Gestionați-vă analize prin organizarea lor în dosare de proiect. Accesa rapid rezultatele anterioare, cu câteva clicuri de mouse sau adăuga noi căutări a proiectelor existente.
  

• Diverse accesorii mici și rezolvări ale unor probleme

Cerințe :

• Mac OS X 10.2 sau superior
• Java 1.4.1 (se recomandă actualizarea 1)
• conexiune la internet
• un cont evaluare Genomatix (gratuit)