Gephi

Gephi este un instrument de a importa, explora, manipula, analiza, filtru, clusterize, spatialise și export grafice și rețele mari

Ce este nou în această versiune:.

• Acest accent lansare pe noi caracteristici pentru utilizatori și dezvoltatori, și noua licență deblocheaza oportunitati de afaceri. Clasamentul și Previzualizare modulele au fost complet rescrise într-un mod modular si poate fi acum extins cu plug-in-uri! Previzualizare poate fi acum extinsă în mai multe moduri, de exemplu, forme de grup sau grupare de margine. Mai mult, progresul continuu s-au făcut pe suport de rețea dinamică și noi eliberați astăzi ultima parte mare: statistici in timp, disponibil de la modulul Statistică atunci când rețeaua este dinamic. Vă mulțumim pentru utilizatorii care au raportat bug-uri, e singura cale de a le rezolva.

Ce este nou în versiunea 0.7 Beta:

• Noile caracteristici:
• New laborator date (Manipulează coloane, Cauta / Replace, Merge, Sparklines ...)
• vizualizare rețea longitudinal, topologie schimba în timp, precum și atribute
• Timeline este acum funcționează corect, apare în mod automat atunci când Graficul este dinamic, un singur buton pentru a activa filtrarea
• Afișare / ascundere etichete din filtre - poate fi resetată prin "Reset vizibile" acțiune (partea stângă a ferestrei graficului)
• Afișare greutate margine ca etichetele de pe vizualizare
• New Stax GEXF importator și exportator, cu ierarhie si suport dinamic
• New List / Arrays tipuri atribut. Pot fi importate numai de la GEXF acum.
• NU Operator (Filtre)
• MASCA Operator (Filtre) - să păstreze muchiile conform sursei / target / ambele / toate - pot obține cu ușurință vecini dintr-un set de noduri
• Flatten Filter - Îndreptați un grafic ierarhic la vizualizarea vizibil, transforma meta-margini în marginile normale
• Filter New gigant Componentă
• Interval de timp import, noua optiune in "Import Report" pentru a importa fișiere statice succesive și transforma în dinamica
• Zoom slider în opțiunile de vizualizare
• opțiunea "Import noduri lipsă" în raportul de import - alege dacă să le creeze sau nu
• Set dimensiunea pentru acțiunea "Reset Size", făcând clic dreapta pe butonul dimensiunea reset
• Obțineți coloană grad de grafice neorientate
• Statistici rapoartele acum salvate în proiecte Gephi
• opțiunea Nou redimensiona Greutate ", în Previzualizare, pentru a forța de greutate arată la fel ca și în general
• opțiunea Nou Original "pentru margini de culoare în previzualizare, păstrează culoarea marginii originale, provenind din Partition de exemplu
• Copiere și pentru a muta noduri la spațiul de lucru noi sau existente
• presetări de previzualizare noi
• Sediu este posibil, și schimba limba de Gephi
• Când marginile paralele sunt găsite în timpul importului, crește acum greutatea marginea implicit
• Opțiune în filtru Ego pentru a include nodul părinte sau nu
• Meta-marginile au acum un slider scară separată în setările de vizualizare, schimba modul de gros sunt comparate cu margini normale
• Clasament și Partition lista de atribute sunt acum clasificate în funcție
• Clasament acum se actualizează cu grafice filtrate. Dacă faceți clic pe Apply va actualiza limitele și transformarea (culoare, dimensiune) este corectă
• Este acum posibil pentru a trage o interogare filtru sub a deveni o interogare principal
• cu atributele dinamice, Clasament, Partition, vizualizare și filtre vor folosi gama Timeline curent pentru a găsi valori
• greutate Edge poate fi dinamic, de tip DYNAMIC_FLOAT. Aspect vigoare Atlas va folosi gama Timeline curent
• Filtrele sunt actualizate atunci când Graficul este modificat, filtrul curent este reexecuted
• Sediu este posibil, franceză și spaniolă vor fi disponibile în curând
• Remedieri de erori:
• margine greșită scos din filtru Edge Greutate (bug 603469)
• Filtrarea cu corpuri convexe afișat (bug 541819)
• NullPointerException când filtrarea grafice neorientate (bug 571153)
• NullPointerException pe importul grafic dinamic (bug 581872)
• GTK + problemă slider (bug 529913)
• Meta-marginile nu sunt afișate (bug 584283)
• Previzualizare nu este afișarea meta-muchii (bug 584289)
• Erori cu Yifan Hu multe niveluri Layout pe un grafic filtrat (bug 594643)
• mod Node Dimensiunea și filtre paramaters nu economisesc în proiectul (bug 596430)
• irosire de memorie în GEXF / GraphML Parser (bug 596872)
• incorect greutate avantaj reciproc pe Previzualizare (bug 610469)
• Progresul nu este afișat atunci când se deschide / salvarea proiectului (bug 594644)
• Nu se poate anula o deschidere proiect (bug 616415)
• Încetineala pe alegerea o intrare de partiție (bug 519549)
• Configurare EdgeList Database nu este salvată (bug 571263)
• "start" și atributele "finale" lipsesc, atunci când exportul GEXF dinamic (bug 521848)
• Partition & quot; All Blacks & quot; facilitate randomizes culori (bug 601066)
• grafic filtrat nu a exportat cu & quot; Select & quot; presat (bug 573685)
• Setări Partition în Filter nu salvate pe spații de lucru de comutare (bug 616052)
• Deschiderea fișierelor arhivate zip este rupt (bug 578876)
• Excepție pe clic pe "Ierarhia" în timp ce rulează aspectul niveluri (bug 631663)

Date
• GraphML importator nu importă etichete nod (bug 581629)
• Nu se poate salva / salvează ca la deschiderea unui Gephi DoubleClick un grafic în Windows (bug 583397)
• ForceAtlas și Fruchterman Reingold nu layouting cu meta-margini (bug 584286)
• irosire de memorie în graficul Distanță (bug 587450)
• NullPointerException la executarea & quot; vector propriu Centralitatea & quot; Statistic (bug 589731)
• NullPointerException la comutarea între spațiile de lucru în timp ce un aspect se execută (bug 597458)
• Nu se poate trage un filtru sub-interogare pentru a deveni o interogare rădăcină (bug 626495)
• parametri Ranking re-inițializat la fiecare rang nou (bug 594231)
• Ranking nu înviorat când grafic filtrat (bug 632459)
• Node invizibil (prea mic), atunci când a creat cu creionul nodul (bug 574807)
• Eroare la deschiderea Plugin Center (bug 616829)
• Nu se poate selecta driver Postgresql în setările de import baza de date (bug 595223)
• Nu se poate afișa greutate margine ca text (bug 603134)
• Import transforma pentru a nedirijate nu fuzioneze greutate (bug 603478)
• Faceți clic dreapta pe spațiul de lucru după ștergerea unui nod aruncă & quot; nod nu poate fi nul & quot; (Bug 605947)
• In / Out grad metric nu funcționează cu grafice neorientate (bug 606305)
• NullPointerException la selectarea & quot; - alegeți un aspect & quot; în ComboBox Layout (bug 606964)
• Workspace Selection nu a reîmprospăta după închiderea spațiului de lucru (bug 616814)
• inversarea culorilor selecție de vizualizare între "afară" și "atât" de culoare (bug 618726)
• "Format" nu a recunoscut pe import DL (bug 619069)
• Editare fereastra nu ascuns pe file (bug 552494)
• grafic dinamic nerecunoscut dacă nodurile veșnice (bug 555637)
• FileNotFoundException timpul economie de fișier PDF (bug 572876)
• & quot; nod trebuie să fie în Graficul & quot; eroare atunci când importă un grafic ierarhic cu înălțime mai mare de 1 (bug 577180)
• Auto-scară răstoarnă Graficul (bug 577843)
• Imposibil de a anula calculul statistic mediu Lungimea căii (bug 590226)
• raport Previzualizare nu este disponibil în prima dată (bug 594176)
• selecție implicită de noduri în laborator Date necesare (bug 594515)
• & quot; CommandLineParsing nul & quot; mesaj de eroare atunci când pe deschiderea dosar la linia de comandă sau desktop (bug 594630)
• Nu se poate importa același fișier de două ori în fereastra Bine ați venit (bug 598157)

Problemă
• fișier CSV export (bug 598767)
• proiect nu poate închide la generarea unui grafic (bug 631341)
• limitare dimensiunea Vizualizare (bug 602470)
• label dublu exemplar în fereastră filtru (bug 604003)
• Paravane nu refresh la deschiderea proiectului nu de ansamblu (bug 612902)
• Z-coordonata nu exportate în GraphML (bug 614606)
• pozitiile nod greșit atunci când stabilirea X sau Y la zero (bug 615844)
• query filtru selectat nu înviorat în mod corespunzător în UI (bug 626483)
• Exportă PDF fundal este întotdeauna alb (bug 583386)
• fișierele SVG care nu figurează în dialog Export (bug 626394)
• size nod greșită când Clasament are aceeași min și dimensiunea maximă (bug 631689)
• Citește poziții din fișiere dot (bug 594793)
• Clasament și parametri partiție nu lista ordonata (bug 594520)
• Node masterat nu Label setările text (bug 598170)
• folder greșită selectat în panoul Export la schimbarea tipului de fișier (bug 620337)
• Generarea un grafic pe un grafic neorientat încărcată anterior (bug 624671)
• greutate accident vascular cerebral greșită atunci când SVG importate în Illustrator (bug 626378)
• Filtrarea nu înviorat când sub-interogări stabilite sau eliminate (bug 594511)
• Erori la export PDF când etichete au dimensiunea fontului zero (bug 626865)
• Textul nu sunt afișate în previzualizare (bug 627567)
• Marginile de culoare nativ nu sunt afișate în previzualizare (bug 586237)
• scară greutate Edge este diferit între Graph și Examinare (bug 569329)
• margini negative nu pronunțate în previzualizare (bug 628223)
• Marginile greutate nu a fuzionat cu margini paralele (bug 648600)
• filtru Partition filtreaza automat valoare nulă (bug 648600)
• Excepție pe fișier proiect de deschidere (bug 648617)
• Ego Filter nu include nodul în sine (bug 649908)
• Exporta PDF doar cu font default (bug 651273)
• Noduri nu neselectat după oprirea Selecția pe panoul Filtru (bug 649920)
• API:
• Adăugați un aplatiza () metoda pentru a HierarchicalGraph pentru a aplatiza Graficul ierarhică și pentru a transforma marginile meta în margini regulate.
• Adăugați distruge (filtru Filter) în FilterBuilder pentru a primi o notificare când o interogare de filtru este îndepărtată și curat-up.
• Adăugați MetaEdgeBuilder în graficul SPI, pentru a permite constructorilor personalizate. Adauga GraphSettings.setMetaEdgeBuilder () în setările modelului grafic.
• Modificare StatisticsModel pentru a stoca rapoarte direct în loc de Statistică instanță. Ca urmare, modelul are acum o getReport () și un getResult () metodă care UI poate folosi. Statisticile în curs de execuție poate fi acum obține cu un nou getRunning () metodă.
• Simplificarea și îmbunătățirea managementului de evenimente atribute. Ascultătorii eveniment acum abona direct din AttributeModel loc de AttributeTable și va primi evenimente pentru toate tabelele. Refactoring clasei AttributeEvent cu AttributeTable ca sursă și un nou obiect AttributeEventData ca date. Un nou SET_VALUE a fost implementat pentru a obține evenimentele atunci când sunt stabilite valorile atributelor.
• Modificări în AttributeRowFactory, metoda newNodeRow () are în prezent obiectul proprietarului NodeData ca parametru. În mod similar pentru newEdgeRow () și newRowForTable ().
• Adăugați getEdge (Node, Node), în GraphAPI din motive de consecvență.
• Modificări în Procesor SPI. Procesorul a setteri acum, în loc de un proces () metoda cu parametrii. Cum procesoare sunt create rămâne aceeași. Crearea unei interfețe pentru configurarea setărilor ProcessorUI procesoare. O implementare ProcessorUI oferă un panou, care este prezentat în cazul în care raportul de import se închide. ProcessorUI permite să dezactivați un procesor cu anumite condiții.
• Adăugați getColor () metoda în NodeDraft și EdgeDraft.
• Definiți & quot; generală, & quot; Laboratorul de date & quot; și & quot; Previzualizare & quot; ca perspective. Creați un nou SPI pentru perspecives și membri de perspectivă. Membrii sunt pur și simplu TopComponent care aparțin unei perspective. Plugin-uri poate implementa PerspectiveMember pentru a defini comportamentul deschide si inchide.
• Adăugați tipuri lista / matrice în Atribute API. Toate tipurile native are acum o listă de tip cauză, cu excepția tipuri dinamice. Tipurile Lista moștenește de la AbstractList.
• Modificări în modul în care se ocupă de import API cu intervale de timp și date dinamice. Suport pentru atribute dinamice a fost adăugat un nou addAttributeValue () metoda în NodeDraft și EdgeDraft. Pentru îmbunătățirea posibilităților de curatare a datelor, NodeDraftGetter și EdgeDraftgetter returnează acum o AttributeRow în loc de o listă cu doar valorile atributelor. În cele din urmă să profite de cele mai recente îmbunătățiri, proiecte de elemente returneaza direct un tip TimeInterval loc de lista de felii. Metode cu "Slice" au fost redenumite pentru "Interval" din motive de coerență.
• Adăugați tipuri dinamice în Atribute API. Tipuri de valori magazin dinamice cu un interval de timp și de interogare poate fi personalizat cu estimatori. Toate tipurile de dinamice moșteni de la DynamicType
• Graph API îmbunătățiri event management. GraphEvent are evenimente acum precise, inclusiv ADD_NODES, REMOVE_NODES, ADD_EDGES, REMOVE_EDGES și VISIBLE_VIEW. O nouă interfață GraphEventData a fost creat pentru a prelua elemente legate de evenimentele.
• Export API refactoring, inspirat din ImportAPI. Creați o interfață ExporterBuilder pentru crearea exportator și diferite exportatori: GraphExporter, VectorExporter, ByteExporter și CharacterExporter care acoperă cazurile comune. Modul exportatori scrie date a fost raționalizată prin utilizarea fie java.io.Writer (text) sau java.io.OutputStream (byte). ExportController a fost îmbunătățit pentru a sprijini toate de uz-cazuri, inclusiv fișiere, scriitor și fluxul de export.
• Adăugați sprijin Spigot la ImportAPI și SPI. Ca DatabaseImporter, interfața SpigotImporter este un nou tip de importatori. Modificările au, de asemenea, făcute la ImportController a sprijini import cep.
• Refactoring și îmbunătățirea API Import și SPI. Refactorizare scopul este de a rezolva problema Singleton cu importatorii și permite utilizatorilor să pună în aplicare interfață constructori care creează importatorii instanță. Prin urmare, o interfață ImporterBuilder a fost creată și ar trebui să fie înregistrate la adnotareaServiceProvider. Tipurile diferite importatori au fost simplificate și se lasă mai multe opțiuni pentru a implementarile despre cum este gestionat de intrare. XML și fișiere text importatori a fost fuzionat într-o interfață FileImporter, lucru cu java.io.Reader. Metode statice de utilitate, de exemplu primi Document de Reader poate fi acum gasite intr-o noua clasa ImportUtils. ImportController a fost simplificat pentru fișiere de import și acum acceptă java.io.Reader asemenea. Principala îmbunătățire pe aceste module în sprijinul componentelor UI pentru importatori. Scopul este de a lăsa importatori defini o implementare ImporterUI pentru a gestiona setările de acești importatori.
• Îmbunătățirea GraphAPI managementul de identificare. Sistemul este acum stocarea de identificare String provenind din utilizatori. Noi getters și metode setteri au fost create în graficul: Graph.setId (Node, String), Graph.setId (Edge, String), Graph.getNode (String), Graph.getEdge (String). Cele NodeData.setId () și EdgeData.setId () Metodele au fost eliminate, compatibilitatea nu pot fi păstrate. Fabrica a fost, de asemenea, modificat pentru a permite crearea elemente cu ID String direct, deoarece nu mai este posibil să o facă din NodeData.
• Schimbări în AttributesAPI cu organizare de evenimente. Sistemul de căutare din AttributeTable a fost înlocuit cu un sistem mai traditional de management eveniment, noi interfete AttributeEvent și AttributeListener. Punerea în aplicare de expediere este, de asemenea prezent pe un fir separat.
• Modificări în modulele de import la interfețele de bază și utilizator separate. ImportController este acum sarcina de import numai și o nouă ImportControllerUI afișează interfața cu utilizatorul (Report Panel). Interfața ImportControllerUI este situat în modulul DesktopProject și ar trebui să fie ușor de utilizat pentru a importa în mod corespunzător fișier de plugin-uri. Metodele ImportController ar putea fi folosite de setul de instrumente.

Ce este nou în versiunea 0.7 Alpha 4:

• Eliberarea alfa4 tocmai a fost lansat, și vin cu un set de caracteristici noi și multe bufixes. Următorul comunicat trebuie să fie beta și să vină cu mai multă stabilitate și un set fix de caracteristici.

Ce este nou în versiunea 0.7 Alpha 3:

• Mai mult de 25 de bug-uri au fost stabilite în această versiune și unele caracteristici mici adăugat. Versiunea adaugă, de asemenea, & quot; Gephi 3rd party & quot; sursa plugin în centrul Plugins. Catalog este citit în prezent din ambele surse oficiale și 3rd party. Au fost adăugate două module noi.

Ce este nou în versiunea 0.7 Alpha 2:

• Noile caracteristici:
• suport greutate margine mai bine. Greutatea nu mai este modificat de & quot; Auto-scară & quot; opțiune de import.

Numărare
• noduri mai bune / margini. Contează doar nodurile vizibile.
• Îmbunătățirea Setări Statistica / Metrics panouri. Adauga descriere și documentare cu privire la valorile și setările lor.
• Project salva / sarcină a fost corectată. Rețineți că compatibilitate cu 0.7alpha1 este rupt.
• Fix mecanism AutoUpdate. Actualizări suplimentare vor fi disponibile prin intermediul built-in updater.
• Remedieri de erori:
• congela aplicare la importul de fișiere de pe Linux (bug 519423)
• Fereastra Layout nu poate fi restabilită atunci când a fost detașată (bug 519424)
• Anner nu sunt vizibile pe Mac OS X și Linux (bug 522403)
• Previzualizare nu ascunde elemente filtrate (bug 522402)
• sarcină de proiect / salva interfață nu (bug 522889)
• Eticheta nod gol produce un mesaj de eroare incorecte în timpul import & quot; unkown nod id & quot; (Bug 519254)
• În GDF export, eliminarea o coloană nu elimină virgula (bug 519810)
• În GDF export, câmpul Id este prost scăpat (bug 519820)
• Caracteristica abatere de filtrare margine (bug 522771)
• Context de date nu funcționează pe nedirijate Graph (bug 522886)

Afișează
• filtrul dinamic 0 nod (bug 523128)
• opțiuni tag funcționează numai pentru valori-o scrisoare (bug 519252)
• Favorite, Proprietati si iesire de meniu apare in fereastra și nu poate fi închisă. (Bug 521400)
• performanțe îmbunătățite când ajustarea gama cu mouse-ul (bug 521939)
• bug fix atunci când se ocupă cu tipuri de date dinamice alte acea dată (bug 521544)
• bug fix cu repartiția vizual de gradații (bug 521941)
• Usability:
• Node și buton de comutare Edge în VizBar au același text tooltip
• Raport Panel (Import) este verticală extensibil
• Module Actualizat:
• DesktopContext
• DesktopBranding
• DesktopHierarchy
• DesktopPartition
• DesktopRanking
• DesktopTools
• VisualizationModule
• DesktopImport
• DesktopLayout
• ProcessorPlugin
• DHNSGraph
• DesktopTimeline
• TimelineAPI
• TimelinePluginUI
• ExportPlugin
• ImportPlugin
• StatisticsPluginUI
• GraphAPI
• ExportPluginUI
• PreviewImpl
• DesktopPreview
• FiltersPlugin
• ImportAPI
• DesktopFilters
• ProjectAPI

Ce este nou în versiunea 0.7 Alpha:

• Versiunea alpha Gephi 0,7 a fost lansat și este disponibil scop testarea. Ca 0.7 este un rescriere completă, aceasta va avea nevoie de versiuni alfa și beta a înghețat caracteristici și rezolva toate bug-uri.
• Toate 0,6 bug-uri rămase vor fi șterse acum.
• O notă suplimentară despre codul sursă: Trebuie să actualizați Netbeans 6.8 cu module curente actualizări pentru a fi compatibile cu repositiory curent
.

Ce este nou în versiunea 0.6 Beta 3:

• Bugs referitoare la 0,6 serie au fost curățate. Am fost reorganizarea să fie clar pentru 0,7 dezvoltare.
• De fapt, 0.7 este complet nou față de 0,6, astfel încât bug-uri nu sunt legate și 0,6 dezvoltare este oprit.
• Prin urmare, singurul lucru de făcut este să așteptăm 0.7 alfa vine.
• Inutil să spun rapoartele bug-uri încă mai există și avem mare grijă să nu repete aceleași greșeli de 0,7.

Cerințe :

• Java 2 Standard Edition Runtime Environment
• OpenGL