InterMine

InterMine prevede rutine de acces la datawarehouses powered by tehnologie InterMine.
InterMine este un open source sistem puternic depozit de date. Folosind InterMine, puteți crea bazele de date biologice accesate de instrumente sofisticate de interogare web. Interpretoare sunt prevăzute pentru integrarea datelor din mai multe formate biologice comune și există un cadru pentru adăugarea de propriile date. InterMine include o interfață web atractivă, ușor de utilizat, care funcționează "out of the box" si poate fi usor personalizat pentru nevoile dumneavoastra specifice.
Toate cod InterMine este disponibil gratuit sub licența LGPL

Ce este nou în această versiune:.

• Conectarea la la InterMine:
• Există mai multe moduri noi de a se leagă în Mine ta. Vezi Link-uri pentru detalii.
• formatele JSON de servicii Web:
• Există mai multe formate de noi rezultate WebService. Aderarea jsonobjects care au apărut în 0,95, acum avem formate JSON pentru destul de mult orice altceva:
• Rezultate:
• jsonrows - reprezentarea tabelară a datelor cu meta-date suplimentare
• & quot; jsontable & quot; . - Format container pentru construirea șabloane încorporate (a se vedea: imbedding tutorial)
• & quot; Nr & quot; și & quot; jsoncount & quot; - Formate pentru a primi doar numărul de o interogare
• webservice meta-date (model și Modele):
• & quot; JSON & quot; - Versiuni cu ușurință poate fi prelucrată, a modelului de date și lista de modele disponibile
• Autentificare Acum Munca în Perl Webservice Client:
• Utilizatorii clientului Perl Webservice au acum acces programatic la listele lor și șabloane private. Pur și simplu furniza datele de autentificare la client pentru a accesa contul dvs. (datele dumneavoastră sunt transmise în format criptat). Această facilitate va lucra cu toate minele cu servicii web, nu doar a celor de la 0.96 și de mai sus.
• Rezultatele obiect cu webservice Clienti:
• Clientii Perl și Java sunt capabili de a obține rezultate înapoi ca obiecte (JSON obiecte, sau în Perl, umflat pana la obiecte pline rezultat). Acest lucru simplifică unele probleme complexe de prelucrare a datelor, și care se ocupă cu exterior se alătură și colecții.
• Mese integrate:
• Puteți acum încorpora nativ tabele de date de la orice mină cu un serviciu web de sprijin în paginile dvs. Web cu JavaScript și CSS. Vezi tutorial imbedding pentru o demonstrație și o introducere a acestei tehnici. Asigurați-vă că pentru a juca în jurul cu noua biblioteca de activarea JavaScript-valabile http://www.intermine.org/lib/imbedding.
• Registrul:
• Am lansat un serviciu de înregistrare centrală pentru implementările InterMine. Acest lucru nu va servi numai ca & quot; de culoare galben-pagini & quot ;, care permite vizitatorilor să descopere noi surse de date-, și facilitarea inter-între minele sine, dar sprijină, de asemenea, servicii web prin furnizarea unui registru de adrese URL webservice și versiuni. Vizitați registru la http://www.intermine.org/registry, și de ajutor în înregistrarea propriu mea, accesați RegisteringYourMine.
• Link Redirecționările:
• Puteți adăuga o proprietate de a avea legături în rezultatele paginile redirecționează către orice adresă URL. Vezi LinkRedirects pentru mai multe informații.

Conținutul paginii
• Home:
• Pagina de start pentru InterMine poate fi acum configurat pentru a afișa diferite informații pe baza sau nu utilizatorul este nou. Vezi HomepageConfig pentru instrucțiuni despre cum se configurează acest comportament.
• Etichetă nouă:
• Am adăugat o nouă etichetă: im: admin. Dacă eticheta un șablon cu im: admin, aceasta nu va apărea în webapp ta. Acest lucru este util pentru a ascunde șabloane nevoie de servicii web InterMine de la utilizatori. Consultați Marcarea de o listă cu toate etichetele disponibile.
• Lista de încărcare:
• procesul de încărcare listă a fost îmbunătățită.
• Alte modificări:
• UPDATE - mai riguroasă corecție testarea ipotezelor multiple pe widget-uri de îmbogățire. & Quot; Număr de teste & quot; este acum numărul de termeni asociați cu lista de referință.
• UPDATE - optiuni de filtrare mai utile cu privire la widget-uri de îmbogățire
• NOU - Holm-Bonferroni opțiune adăugată la widget-uri de îmbogățire
• UPDATE - nou & quot; șterge & quot; buton de pe pagina listele
• UPDATE - interacțiuni displayer încărcată prin AJAX astfel reclami loturile pagina mai repede
• FIX - & quot; scor & quot; afișarea imaginilor corect pe rezultatele de căutare
• UPDATE - QueryBuilder mai interactiv, selectarea unui element din lista vă va duce înapoi la elementul original după pagina de reîmprospătare / reload
• UPDATE - Link adăugat la rezumat coloană în rezultatele interogării, luare este mai ușor pentru a vedea valori distincte
• FIX - autentificare bug privind numele de utilizator regim mixt
• FIX - bug widget atunci când vizualizați după exportul datelor widget
• NOU - interogări șablon sunt ordonate dupa popularitate, dacă nu sunt logat, în cazul în care acestea sunt ordonate de la data fiecare interogare a fost ultima dată centrare
• FIX - datele nu se repetă în & quot; quot diverse-; secțiune pe paginile de raport
• FIX - template-uri afișate corect pe pagina report chiar pentru subclase
• FIX - template-uri de randare corect în paginile de aspect
• UPDATE - actualizat convertor BioGRID să se ocupe de schimbari in cele mai noi fișiere de date
• FIX - diverse & quot; aur & quot; temă CSS și imagini îmbunătățite și actualizate
• FIX - probleme de siguranță fir abordată în șablon urmărire
• UPDATE - widget-uri de masă poate grupă de un atribut, precum și o clasă

Cerințe :

• Python