PANAMA

PANAMA este un model de nou probabilistic a tine cont de factorii de confuzie în studiile eQTL, scrise în Python.
Factori de confuzie ascunse, cum ar fi variabile concomitente neobservabile sau perturbatii de mediu subtile necunoscut poate crea asociații false false sau masca reale semnale de asociere genetice. Spre deosebire de metodele anterioare, PANAMA învață factori ascunse în comun cu efect de autoritățile de reglementare genetice importante. Ca urmare, acest nou model poate distinge mai precis semnale reale de asociere genetică de la variație intricate.
N. Fusi, O. Stegle și ND Lawrence, "modelarea comună a factorilor de confuzie și autoritățile de reglementare genetice importante prevede precizie sporită în genomica genetice studii", PLoS Computational Biology, 2012
Mai multe informatii la http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html

Requirements:

• Python