QuasiRecomb

QuasiRecomb este o aplicație ușor care ruleaza in consola comanda, simulând un model Markov pentru generarea cvasispecii virale. Acesta descrie generarea cvasispecii virale și o metodă de a deduce parametrii de analiza datelor secventiere de generație următoare. Modelul este validat pe date simulate, arătând avantajul de a lua în mod explicit procesului de recombinare în considerare, și testate prin aplicarea citește obținute din probe experimentale HIV. Acesta oferă o punere în aplicare a algoritmului EM pentru a găsi maxime estimări a posteriori a parametrilor modelului și o metodă de estimare a distribuției de tulpini virale în cvasispecii

Cerinte :.

Java