SimSoup

SimSoup este un simulator grafic chimie naturala pentru Linux si Windows.
Programul permite o chimie care urmează să fie definite în termeni de tipuri moleculei și posibilele interacțiuni dintre ele. Un traseu de simulare implică crearea unui număr de molecule de diferite tipuri molecula in-un reactor, iar apoi permițând Interacțiuni să aibă loc într-o perioadă de timp. Interacțiuni loc în reactor sunt afișate pe un display grafic.
Motivația pentru dezvoltarea programului este de a permite investigații în comportamentul rețelelor, în special în ceea ce privește "metabolism primul" teorii ale originii vieții, deși proiectul de bază al SimSoup sprijină modelarea orice rețea în care interacțiunile poate avea loc între noduri.
În prezent, dezvoltarea SimSoup a atins stadiul de prototip.
Iată câteva caracteristici cheie ale "SimSoup":
ย ท A Chimie: inclusiv tipurile moleculei și tipuri de interacțiune
ย ท un reactor: În ce interactiunile avea loc între moleculele diferitelor tipuri
ย ท Vizualizări grafice ale Chimie și Reactor statului
ย ท afișare grafică a Simulare Statistici, inclusiv: -
- Terenuri Timpul Seria: Acestea arată comportamentul seriilor de timp de o serie de variabile care sunt monitorizate ca ruleaza de simulare
- Plot Manhattan: Aceasta arată variabilitatea compoziția materialului din reactor a lungul timpului
ย ท Trackers și Ciclul de detectare (NOU): Acestea permit cicluri de detectat și monitorizat
ย ท Conservarea Mass
ย ท căldură și Termodinamica (NOU): ratele de reacție se bazează pe considerente de energie și termodinamicii
ย ท Afișaj Scenariul: Un ecran de scenarii și starea curentă informații cu privire la progresele înregistrate
ย ท Cereri de acțiune (NOU): Acestea sunt evenimente care pot fi programate să aibă loc în anumite momente. De exemplu, un Cerere de acțiune poate fi configurat pentru a determina o molecula de un anumit tip să fie adăugate la reactorul
ย ท intrare Processor (NOU): Aceasta permite un scenariu de simulare să fie definită într-un fișier și încărcate la SimSoup
ย ท Sistem Monitor: A (parțial ascuns) ecran - în principal pentru scopuri de diagnosticare
ย ท interfață de utilizator îmbunătățită bazată pe deplin GTK (NEW)
Cerinte:
ย ท GSL (GNU Library Scientific)
ย ท gtkmm (A C ++ interfață la biblioteca GTK + GUI)
Ce este nou în această versiune:
ย ท Trackers și Ciclu de detectare: Acestea permit cicluri de detectat și monitorizat
ย ท căldură și Termodinamică: ratele de reacție se bazează pe considerente de energie și termodinamicii
ย ท Cereri de acțiune: acestea sunt evenimente care pot fi programate să aibă loc în anumite momente. De exemplu, un Cerere de acțiune poate fi configurat pentru a determina o molecula de un anumit tip să fie adăugate la reactorul
ย ท Procesor Input: Acest lucru permite un scenariu de simulare să fie definită într-un fișier și încărcate la SimSoup
ย ท interfață de utilizator îmbunătățită bazată pe deplin GTK.