Swiss-PdbViewer (aka DeepView) este o aplicație care oferă o interfață prietenoasă care să permită să analizeze mai multe proteine, în același timp. Proteinele pot fi suprapuse pentru a deduce aliniamente structurale și compara site-urile lor active sau orice alte părți relevante. Mutații aminoacid, H-obligațiuni, unghiuri si distante intre atomi sunt ușor de obținut datorită interfeței grafice și meniul intuitiv.
Swiss-PdbViewer (aka DeepView) a fost dezvoltat din 1994 de Nicolas Guex. Swiss-PdbViewer este strâns legată de SWISS-MODEL, un server de modelare omologie automatizate dezvoltat în cadrul Institutului elvețian de Bioinformatica (SIB) la Bioinformatica Grupul structurale la Biozentrum din Basel.
Lucrul cu aceste două programe reduce foarte mult cantitatea de muncă necesară pentru a genera modele, cum este posibil să se fir o secvență de proteină primar pe un șablon 3D și de a lua o feedback imediat de cât de bine va fi proteina filetat acceptate de către structura de referință înainte de a prezenta o cerere pentru a construi bucle lipsă și rafina ambalare catenă laterală.
Swiss-PdbViewer poate citi harti densitate de electroni, și oferă diverse instrumente pentru a construi în densitatea. În plus, diverse instrumente de modelare sunt fișiere integrate și de comandă pentru pachetele populare de minimizare a energiei pot fi generate.
În cele din urmă, ca un bonus special, scene POV-Ray pot fi generate de vizualizarea curentă în scopul de a face fotografii uimitoare de calitate trasat-ray.
Ce este nou în această versiune:
- Atomul timină C6 este acum corect încărcat
- fix POV-Ray ieșire bucla fără sfârșit pe versiunea de PC
- accident ocazional în timp ce salvarea fișierelor din PPB (cum ar fi 2i37) de pe PC-ul a fost stabilit
- Actualizat adresa Uppsala Electron Densitate Harta Server
Comentariile nu a fost găsit