MacVector

        MacVector este o aplicație complexă Macintosh care oferă editarea secvențelor, designul de bază, căutarea de baze de date pe internet, analiza proteinelor, confirmarea secvenței, alinierea secvențelor multiple, reconstrucția filogenetică, analiza regiunilor de codare și o mare varietate de alte funcții. MacVector este considerat ca fiind cel mai intuitiv, ușor de utilizat program disponibil pentru analiza secvențelor.
    

Ce este nou în această versiune:

Unele probleme minore cu Aliniere la referință atunci când se citește aliniate începând cu ultimul rest de secvențe circulare au fost reparate.

Ce este nou în versiunea 16.0.6:

Unele probleme minore cu Aliniere la referință când este citit aliniat începând cu ultimul reziduu al secvențelor circulare au fost reparate.

Ce este nou în versiunea 16.0.2:

A fost rezolvată o eroare la invocarea funcției Align to Add Add Seqs pe OS X 10.7 și OS X 10.8 .

Când exportați o secvență în format GenBank, MacVector scrie acum toate funcțiile GenBank, chiar dacă acestea sunt în prezent depășite.

Ce este nou în versiunea 15.5.4:

Ieșirea de digestare a enzimei de restricționare funcționează acum cum este de așteptat când sunt selectate doar două sau trei enzime.

Ce este nou în versiunea 15.1.4:

Traducerea cadrului 3/6 în editorul de secvențe unice întreține acum corect cadrul
după o înfășurare de linie.

Un accident când porniți traducerea cadrelor 3/6 în Editorul de referință Aliniere la un a
secvență mai mare de 65.000 de reziduuri a fost rezolvată.

Ce este nou în versiunea 15.1.3:

A fost rezolvată o eroare în Editorul de Aliniament Secvență Multiplă . Efectul acestei bug-uri a fost că alte reziduuri au apărut uneori la începutul secvențelor când au fost salvate. Acest lucru a afectat numai documentele MSA care au fost editate. Dacă ați aliniat cu ClustalW / Muscle / T-Coffee și ați salvat fără editare, alinierile ar fi corecte.

Ce este nou în versiunea 15.1.1:

Blochează la salvarea anumitor alinieri de secvențe multiple
(.msan, .msap) au fost rezolvate.

Un bug în cazul în care unele citiri rapidq vor fi scrise de mai multe ori din rezultatele unei căutări Align To Folder au fost rezolvate.

Ce este nou în versiunea 14.5.3:

A fost rezolvată o accidentare ocazională în funcția Align To Folder.

A fost rezolvată o accidentare rară când testarea perechi de primeri a fost rezolvată

Ce este nou în versiunea 14.5.2:

Alinierea la dosar gestionează corect căutările utilizând segment al unei secvențe care traversează originea circulară.

Activarea / dezactivarea funcției "Căutare automată RE" în Preferințele hărților actualizează toate ferestrele deschise.

Ce este nou în versiunea 14.0:

Împreună cu creșterea performanței atunci când lucrați cu secvențe mari și aliniamente, există îmbunătățiri semnificative ale manipulării primelor (inclusiv suport pentru bazele de date) și a datelor NGS.

Ce este nou în versiunea 13.5.5:

O problemă în care caracteristicile tipului "????" ar fi creat la deschiderea unui fișier salvat Align To Reference (.axml) salvat.

Ce este nou în versiunea 13.5.3:

• Afișarea editorului Contig actualizează în mod corect pe OS X 10.6 când se încarcă o aliniere salvată.
• Un accident a fost reparat în caseta de instrumente pentru analiza proteinei.
• A fost rezolvată o eroare în interfața Quicktest Primer atunci când lucrați cu un număr mare de enzime de restricție.

Ce este nou în versiunea 13.5.2:

A fost rezolvată o problemă de derulare în editorul Contig Editor / Align To Reference Editor. A fost rezolvată o accidentare rară când a trezit într-o altă rețea.

Ce este nou în versiunea 13.5.1:

• Pe OS X 10.6, secvențele importate își păstrează acum numele original al fișierului.
• O secvență modificată ocazional de închidere a accidentului care nu a fost salvată a fost rezolvată.
• Traducerile din ieșirea textului adnotat acum onorează corect steagurile de preferințe.
• S-au rezolvat unele inconsecvențe în numerotarea secvențelor "untitled".
• O problemă în care ferestrele de secvențe ar dispărea sub OS X 10.6 au fost rezolvate,
• Un număr de erori de afișare din editorul Align To Reference au fost rezolvate.
• O problemă în care uneori lipsesc traducerile în fila Hartă când a fost mărită la nivelul reziduurilor a fost fixată.
• Abilitatea de a importa fișiere BAM într-un proiect Assembler a fost restaurată.
• Documentele de aliniere multiple a acidului nucleic au acum propriul lor grup de culori și blochează valorile implicite.
• Primerii în modul "Test PCR Primer Pair" al Primer Design pot avea acum peste 35 nt.
• Vizualizările de text se redimensionează automat în lățime pentru a imprima pe o singură pagină.

Ce este nou în versiunea 13.5:

Editorul de simbol grafic și paleta grafică plutitoare au fost rescrise pentru pregătirea pentru mutarea MacVector pe o arhitectură pe 64 de biți (datorată MacVector 14.0). Celelalte îmbunătățiri principale au vizat o mai bună manevrare a fișierelor de secvențiere de generație următoare (NGS), în special cu funcția de asamblare Align To Folder și Assembler Velvet de novo. De asemenea, a existat o anumită optimizare a codului pentru o mai bună gestionare a analizei secvențelor genomice mari, în special remarcabile cu funcționalitatea "dot-plot" a matricei Pustell.