PathVisio este o sursă deschisă și aplicarea grafic complet gratuit implementat în limbajul de programare Java și proiectat de la sol până să fie utilizate pentru afișarea, analiza și editarea cai biologice în cadrul unui operare GNU / Linux system.Can fi utilizat pentru a desena cai , link-ul de software entitiesThe biologic permite utilizatorilor să elaboreze cai, link entități biologice (proteine sau gene) la date biologice, folosind identificatori de baze de date, editarea cai, precum și pentru a analiza cai. Cu PathVisio va fi, de asemenea, posibilitatea de a harta date experimentale, cum ar fi datele microarray, și vizualiza-l pe partea de sus a desenului cale existent.
În plus, va fi capabil de a selecta o bază de date genă, selectați o bază de date metabolic, vizualiza statistici, date de expresie import, selectați exprimare seturilor de date, căi de căutare, vedere legenda, manipula obiecte, proiecte de import, precum și pentru a instala și de a gestiona plugin-uri, care poate adăuga funcționalitate suplimentară la app.Requires nicio cerere de installationThe pot fi utilizate fără a instala pe sistemul de operare GNU / Linux. Tot ce trebuie să faceți este să descărcați pachetul binar din Softoware, salvați arhiva pe o locație aleasă de dumneavoastră, se extrage folosind un utilitar de manager de arhive, deschide directorul extras, și dublu click pe pathvisio.jar file.Under hoodWhile a lua o privire rapidă sub capota a software-ului PathVisio, ne-rsquo; am observat că cererea este scris în întregime în limbajul de programare Java, și că interfața grafică cu utilizatorul este conceput cu cele mai recente tehnologii Java Swing. Ne rsquo; am testat cu succes aplicația pe calculatoarele care susțin oricare dintre architectures.Runs CPU 32 sau 64 de biți pe orice sistem de operare în care Java este supportedBeing scrise în limbajul de programare Java, PathVisio poate fi declarat o aplicație independent de platforma care suporta GNU / Linux , Microsoft Windows, Mac OS X, BSD, Solaris, precum și orice alt sistem de operare în cazul în care sunt susținute cele mai noi tehnologii Java
Ce este nou în această versiune:.
- 31 ianuarie 2014: Bug versiune fix
- termeni GeneOntology sunt acum eliminate din rezultatele căutării pentru adnotări
- DataNodes trebuie adnotat cu ID-ul și Sursa de date sau nimic (salvare noduri de date cu doar ID-ul sau sursă de date nu mai este permis)
Ce este nou în versiunea 3.1.2:
- bug majore în modul fișier de import fix: http: //developers.pathvisio.org/ticket/1697
Ce este nou în versiunea 2.0.11:
- Salvare automată
- Zoom folosind rotița de derulare
- Selectarea liniilor este mai ușor: nu mai este necesară să faceți clic pe pixelul exact
- Acum, cu două metode de analiză supra-reprezentare; o cale orientată-și un orientate spre date
Ce este nou în versiunea 2.0.10 :
- nou mod de desen dreptunghiuri rotunjite, pentru a evita întindere efect
- Diverse rezolvări ale unor probleme mici
Ce este nou în versiunea 2.0.9:
- Un nou tip conector pentru conector de lungime arbitrară și arbitrară unghiurile
- nou & quot; component celular & quot; proprietate pentru stocarea sensul biologic al unui compartiment
- nou & quot; dubla & quot; Tipul linie (utilă în special pentru organite dublu-membraned)
- hyperlink-uri se poate face clic în cai
- vezi punct de reper: & quot; milestone_27 & quot; pentru o listă completă a bug-remedieri
Ce este nou în versiunea 2.0.8:
- forme îmbunătățite pentru componente celulare
- Cateva imbunatatiri de uzabilitate, cum ar fi copy / paste din meniul pop-up
- vezi punct de reper: & quot; milestone_26 & quot; pentru o listă completă a bug-remedieri
Ce este nou în versiunea 2.0.7:
- icoane bara de instrumente și noi panou lateral a face mai ușor a selecta tipurile de săgeată și forme (mulțumiri liubing)
- baze de date cu traiectorie sunt incluse ca sursă de date, astfel încât să puteți adăuga link-uri de la o cale la alta
- BioPAX Convertor a fost îmbunătățit și produce documente BioPAX mai valabile.
- nou tip conector unde puncte individuale pot fi manipulate (mulțumiri leonth)
- Numărul de surse de date a crescut la peste 180
- vezi punct de reper: & quot; milestone_25 & quot; pentru o listă completă a bug-remedieri
Ce este nou în versiunea 2.0.6:
- Numărul de ancore pe o formă poate fi crescută de la implicit 12.
- O legendă a vizualizării datelor poate fi acum afișate pe imaginea calea în sine. Anterior, a fost vizibil doar într-un panou lateral.
- vezi punct de reper: & quot; milestone_24 & quot; pentru o listă completă a bug-remedieri
Ce este nou în versiunea 2.0.4:
- îmbunătățit formatarea textului de forme, etichete și datanodes
- mult mai multe forme de datanodes
- coordonate pixeli simplu
- seta culoarea de fundal pe datanodes
Ce este nou în versiunea 2.0.3:
- Cele mai notabile în această versiune este noua schema XML pentru formatul GPML cale (versiune 2010a). Acest nou format cale va permite multe noi capabilități grafice viitor, poti sa te uiti cu nerăbdare să unele dintre cele care apar în următoarea lansare.
- Alte caracteristici noi:
- ancore invizibile sunt într-adevăr invizibil, cel puțin atunci când ceva este conectat la ele (Datorită Margot)
- extraopțiunii linie de comandă -v (datorită Marcu)
- baza de date selectată este afișată în mod corespunzător în bara de stare din nou
- Multe dintre noi puncte de extensie pentru dezvoltatorii de plugin
- vezi punct de reper: & quot; milestone_21 & quot; pentru o listă completă a bug-remedieri
Ce este nou în versiunea 2.0.1:
- algoritm îmbunătățit pentru conectori automate care indică o ancoră .
- desen îmbunătățită de tipuri de săgeți care au un scurt & quot; decalaj & quot; la sfârșitul anului.
- Deoarece serviciul Thawte freemail a fost anulat, ne-am actualizat nostru Certificat de securitate
- Calea Istoric de vizualizare a avut o problemă în cazul în care a fost considerat fiecare linie modificate, chiar dacă nu a fost. Acest lucru a fost stabilit.
Cerințe :
- Oracle Java Standard Edition Runtime Environment
Comentariile nu a fost găsit