Topographica

Topographica este un pachet software pentru modelarea computationala de hărți neuronale.
Obiectivul este de a ajuta oamenii de stiinta inteleaga functiile creierului la nivelul hărțile topografice care alcătuiesc sistemele senzoriale și motorii.
Topographica este destinat să completeze mai multe simulatoare de nivel scăzut neuron bune care sunt disponibile, cum ar fi Geneza și Neuron. Aceste simulatoare se concentreze pe modelarea comportamentului intern detaliate de neuroni și rețele mici ale acestora.
Topographica schimb se concentrează pe structura pe scară largă și funcția care este vizibila doar atunci când mai multe mii de astfel de neuroni sunt conectate în harti topografice care conțin milioane de conexiuni.
Mulți fenomene importante nu pot fi studiate fără astfel de rețele de mari, inclusiv organizarea bidimensional de orientare vizuală și hărți de direcție de mișcare, și segmentarea obiect și a proceselor de grupare.
Pentru a face astfel de modele practice, în Topographica unitatea fundamentala este o foaie de neuroni, mai degrabă decât un neuron sau o parte a unui neuron.
Pentru cele mai multe simulări, foile pot fi puse în aplicare la un nivel ridicat, format din ardere-rata abstract sau neuroni integra-și foc.
Atunci când este necesar pentru validarea sau pentru fenomene specifice, Topographica poate fi extins cu ușurință cu ajutorul unui foaie care interfețe la modele mai detaliate neuronale în alte simulatoare.
Foi detaliate-Mai pot fi de asemenea utilizate temporar, de exemplu atunci când interacționează cu modelul în timp real.
De-a lungul, Topographica face simplu de utilizat un nivel adecvat de detaliu și complexitate, determinat de puterea de calcul disponibilă, fenomenele de interes, și cantitatea de date biologice disponibile pentru validare.
Cifra din dreapta sus prezinta un exemplu de model Topographica de primele etape ale sistemului vizual, modelarea cum retinei de intrare este transformat de talamus, cortexul vizual primar, și zonele corticale superioare. Deoarece Topographica este un scop general hartă simulator, sprijină, de asemenea orice altă modalitate senzorială care este organizat în hărți topografice, cum ar fi tactil și auzul, precum și zonele motorii.
Topographica este disponibil gratuit pentru descărcare, și este un proiect open source, acesta poate fi extins capacitățile și modificat de orice utilizator. Noi bun venit contribuții din partea utilizatorilor, și invită persoanele interesate să se alăture echipei noastre de dezvoltare distribuite la nivel global.
Deși codul este încă în curs de dezvoltare foarte activ, este în uz de zi cu zi în numeroase proiecte de cercetare și clase academice.
Având în vedere ritmul rapid de dezvoltare actual, fiind un dezvoltator este, probabil, cel mai bun mod de a ține pasul cu toate modificările.