Serial Cloner

Cloner serial este un software biologie moleculara. Acesta oferă instrumente cu o interfață intuitivă care vă ajută în clonarea ADN-ului, analiza secvenței și vizualizare. Cloner Serial a fost dezvoltat pentru a oferi un software de lumină biologie moleculara atât utilizatorii de Macintosh și Windows. Cloner Serial citește și scrie ADN Strider (tm) fișiere compatibil și fișiere de import și export în format FASTA universal (la fel de bine ca în format pDRAW32). Instrumente puternice de afișare grafic și interfețe simple, ajuta de analiză și de construcție etapele (adaptor, PCR, Gateway [tm] clonare) într-un mod foarte intuitiv. Versiunea 1.3 adauga acum un tăietor virtuala, un browser web cu importul instantanee de intrări NCBI / EMBL și o hartă de restricție tăcut împreună cu alte îmbunătățiri.

Ce este nou în această versiune:

• [NEW] Estimările punct izoelectric de secvențe de proteine ​​(ADN și proteine ​​Secvență Fereastra)
• Versiunea [NEW] MacOSX acum distribuit ca o aplicație semnat (compatibilitate Mountain Lion Gatekeeper)
• [noastră] O opțiune în Preferințe pentru a selecta tabele valoare pK de a utiliza pentru estimarea pl
• [noastră] O opțiune în Preferințe pentru a folosi codul Codon din tabele utilizarea codonului ca un cod genetic folosi in traducere
• [noastră] O opțiune în fereastra de restricție Harta numai traduce nucleotide care sunt în majuscule
• [noastră] un buton / meniu pentru a alege anumite site-uri să fie afișate în hărți de restricție.
• [noastră] Scanați pentru Caracteristici peptide din secvente de proteine ​​
• [noastră] Moștenire Caracteristici când o secvență de ADN traducere inversă
• [noastră] Un comutator rapid între o ADN și proteine ​​fereastră alinierea
• [noastră] Non formatată copie a secvenței de proteine ​​(Copiere Mai mult ... Meniu)
• [noastră] Moștenire Caracteristici când secvențele copiere / lipire de proteine ​​
• [noastră] Caracteristici afișaj în proteine ​​Align (Aliniere Local)
• [noastră] Un buton de comutare pentru a evidenția diferențele de proteine ​​aliniate
• [noastră] A acces rapid (S) pentru a afișa rapid sau masca Caracteristici (în fila Features secvenței Windows)
• [noastră] "ancora" și domeniile "fundamentale" de primeri sunt acum recunoscute ca caracteristici în ordine pentru Windows
• [noastră] Un buton pentru a selecta rapid o inserție liniar complet in fereastra "Build-un construct"
• [noastră] Adăugat o scurtătură spre 'Copy Non formatat "[COMANDA-SHIFT-K]
• [noastră] O intrare meniu pentru a merge la Serial Cloner Forum
• [noastră] O intrare meniu pentru a merge la Cloner Serial Youtube Channel (tutorial)
• [ACTUALIZAT] Acum este posibilitatea de a redimensiona complet ferestre secvență
• [ACTUALIZAT] site-uri Absent sunt indicate în italice în ferestre Chooser de enzime (grafice și restricționarea Maps)
• [ACTUALIZAT] site-uri unice sunt indicate cu caractere aldine în ferestre Chooser de enzime (grafice și restricționarea Maps)
• [ACTUALIZAT] Parsing de secvențe NCBI (Web Access), pentru a ține în considerare modificările aduse paginile NCBI.
• [ACTUALIZAT] parsarea îmbunătățită a secvențelor care conțin "X" în secvența de nucleotide
• [ACTUALIZAT] acces rapid schimbat de "Copy toate secvențele Spre Multifasta" a [COMANDA-SHIFT-J] în loc de [COMANDA-SHIFT-K]
• [corectate] Un bug interfață Windows specific fereastra "de import Codon deviației"
• [corectate] Un bug prevenirea uneori copie corectă a imaginilor (hartă Graphic, Virtual Cut, shRNA) în clipboard (Windows specific)
• [corectate] O problemă apărută cu nume neobișnuite, cum ar fi RE R1.BceSIV în special enzima "selectorul de Harta Graphic.
• [corectate] O problemă [Gateway Clonarea] cu indicarea Caracteristici când vectorul destinație a fost antisens (direcția att2 att1)
• [corectate] Un bug în alegerea cele mai utilizate AA când traducere inversă
• [corectate] O problemă cu "Select All", în ordine și de proteine ​​ferestre
• [corectate] O problemă Tip de fișier asociat la fișiere Cloner Serial (rupere compatibilitate cu import Sequencher în special)
• [corectate] Legarea: Uneori produsă în mod inutil degenerat ADN
• [corectate] Gateway: ADN-ul generat, dar apoi, când apoi salvat ca tip necunoscut
• [corectate] PCR:. În cazul în care face pe "format necunoscut" secvență, tip generat incorect "proteine"
• [corectate] O problemă actualizarea caracteristică atunci când desfacerea o modificare
• [corectate] Când lipirea o secvență de proteină în format GenBank (NCBI)-o fereastră secvență de proteină este acum creat corect.
• [corectate] O problemă cu serverul BLAST NCBI atunci când se utilizează caractere non-ASCII în numele secvență
• [corectate] O problemă cu afișaj Feature după o scanare, când a fost găsit de un singur Element
• [corectate] O problemă rară de afișare caracteristică din fereastra Construct
• [corectate] O problemă actualizează atunci când se utilizează dimensiuni caracter diferit de 12 pt în hărți grafice.
• [corectate] Un bug in harta de restricție ferestrele în cazul în care prima linie de traducere aminoacid a fost mutat în mod codonul
• [corectate] Un bug legate de prevenirea utilizării enzimelor selectate anterior în Virtual Cutter fereastra