RAPTOR

RAPTOR este un software inovatoare proiectate pentru precisă predictie structura de proteine. Acesta combină instrumente de analiză avansate într-o soluție software integrată și oferă trei metode de filetat diferite. Unic de abordare a RAPTOR optimizare programare întreg este cel mai eficient pentru identificarea modele structură de obiective cu omologie de secvență redusă și este capabil de a genera modele de înaltă calitate. Interfața ușor de utilizat și ușor de înțeles valorile E sunt ideale pentru incepatori si experti. Mai presus de toate, afișajul intuitiv de ieșire permite utilizatorilor să înțeleagă rezultatele pur și simplu dintr-o privire. Având în vedere o secvență de proteină țintă, în cazul în care există o proteină omoloagă cu cunoscută structura 3D, poate fi găsit prin utilizarea instrumentelor de căutare secvență ca PSI-BLAST, de asemenea, furnizate în RAPTOR. Structura țintei este apoi construit din structura cunoscută; cu toate acestea, în cazul în care omologia de secvență nu este semnificativă, adică mai puțin de 25%, PSI-BLAST nu poate veni cu un hit încrezător. Spre deosebire de PSI-BLAST, care pur și simplu nu o căutare secvență, filetare proteine, ori recunoașterea, face uz de atât informații omologie și structura. Acesta scanează secvența proteinei cu o structură necunoscută împotriva unei baze de date de structuri cunoscute. Prin utilizarea unei funcții de notare și efectuarea analizei compatibilității între structuri tridimensionale si secvente de proteine ​​liniare, cel mai bun șablon structural vor fi identificate de la care să construiască structura secvenței de. Ca urmare, filetare proteine ​​oferă o predicție superioară decât modelare omologie atunci când există marginal omologie de secvență

Limitări :.

funcționalitate limitată