BioRuby

BioRuby oferă un mediu integrat pentru Bioinformatica (biologie știință Informații).
Obiect limbaj de scripting orientat Ruby are multe caracteristici potrivite pentru cercetare bioinformatica, de exemplu, să-și exprime clar sintaxă obiecte complexe, expresii regulate pentru manipularea textului fel de puternic ca Perl & rsquo; s, o mare varietate de biblioteci, inclusiv serviciu web etc.
Ca sintaxa Ruby este simplu și foarte curat, credem că este ușor de a învăța pentru incepatori, usor de folosit pentru biologi, si, de asemenea, suficient de puternic pentru dezvoltatorii de software.
În BioRuby, dezvoltatorul poate prelua intrări biologice de baze de date din fișiere plate, servere de web de internet și baze de date relaționale locale.
Aceste intrări de baze de date pot fi analizat pentru a extrage informațiile de care aveți nevoie. Secvențe biologice pot fi tratate cu metodele împlinirea Ruby & rsquo; s clasa String si cu expresii regulate.
Biblioteca poate fi integrat cu instrumente, cum ar fi Blast, Fasta, Hmmer și multe alte pachete software pentru analiza biologica.
 BioRuby suporta formatele majore de baze de date biologice și oferă mai multe moduri pentru accesarea lor prin indexarea flatfile, SQL, servicii web etc. Diverse servicii web, inclusiv KEGG API pot fi ușor utilizate de BioRuby.

Caracteristici :

• BioRuby coajă
• API
• Documentation

Cerințe :

• Ruby 1.8.7 sau mai mare