Gabedit

Gabedit este o interfață grafică pentru utilizator pentru a Gaussian, Molcas, Molpro și MPQC pachete chimie computațională.
 
 Gabedit include facilități grafice pentru generarea de cuvinte cheie și opțiuni, specificații molecule și secțiuni lte de intrare chiar si pentru cele mai avansate tipuri de calcul Gabedit include un constructor Molecule avansat.
 
 Îl puteți folosi pentru a schița rapid în molecule și să examineze-le în trei dimensiuni. Puteți construi molecule de atom, inel, grupare, amino acizi si nucleozidici. Puteți citi, de asemenea, geometria dintr-un fișier. Majoritatea formatelor de fișiere mari moleculare sunt acceptate.
 
 Gabedit include o fereastră de calcul Setup Gaussian, Molcas, Molpro și MPQC care vă permite să configurați gaussiene, Molcas, Molpro și MPQC de locuri de muncă într-o manieră simplă și directă.
 
 Gabedit include un editor de text pentru editarea Molcas, Molpro, fișiere de intrare Gaussian și MPQC.
 
 Gabedit poate afișa grafic o varietate de Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC și (parțial) rezultatele calculelor ADF, inclusiv următoarele:
 
 ย ท orbitali moleculari.
 ย ท suprafete de densitatea de electroni, potențialul electrostatic, RMN densitatea de protectie, și alte proprietăți.
 ย ท Suprafetele pot fi afișate în modurile de plasă solide, translucide și sârmă.
 ย ท Suprafetele pot fi colorate de o proprietate separată.
 ย ท Contururi (codificate cu ajutorul culorilor).
 ย ท Avioane (codificate cu ajutorul culorilor).
 ย ท Dipol
 ย ท axe XYZ și axele principale ale moleculei.
 ย ท Animație a modurilor normale corespunzătoare frecvențelor vibrationale.
 ย ท Animarea rotație a geometriei, suprafață, dipol, xyz iar axele principale ale moleculei.
 ย ท Animație de contururi.
 ย ท Animație de avioane codificate cu ajutorul culorilor.
 
 Gabedit poate afișa IR și Raman calculat spectrele. Gabedit poate genera un fișier povray pentru geometrie (atomi + obligațiuni, inclusiv legături de hidrogen lui), suprafețe (inclusiv suprafețele codificate cu ajutorul culorilor), contururi, avioane codificate cu ajutorul culorilor.
 
 Gabedit poate salva imagini în format PS PPM, BMP, (JPEG) și. Gabedit poate genera automat o serie de imagini pentru animație (vibrații, convergență geometrie, rotație, contururi, avioane codificate cu ajutorul culorilor)

Ce este nou în această versiune:

• bug-uri minore au fost stabilite.
• NWChem este acum suportat.
• native jocuri pentru Windows este acum suportat.

Ce este nou în versiunea 2.3.5:.

• bug-uri minore au fost stabilite
• Atomii pot fi fixate în timpul unei dinamici de simulare moleculara.
• Migrarea de la Cairo la OpenGL pentru desen fereastra geometrie.
• Migrarea de la gtkglarea la GtkGLExt.
• Paralelizare folosind OpenMP.

Ce este nou în versiunea 2.3.0:.

• bug-uri minore au fost stabilite
• Utilizatorul poate citi orbitalii, geometria și modurile normale dintr-un fișier Gaussian fchk.
• Se poate citi orbitalii de noul format de fișier aux Mopac (inclusiv formatul comprimat).
• Mai multe noi opțiuni în XYPlot și ContoursPlot ferestre (insert text, linie, sageata, imagini, teme noi ...).
• Lungimile de obligatiuni pot fi fixate în timpul o simulare MD.
• optimizare parțial este posibil acum cu potențialul MM.
• Punerea în aplicare a unui instrument pentru a prezice masele și abundența de izotopi pentru o moleculă dată. Punerea în aplicare a unui instrument pentru a calcula susceptibilitățile electrofile, nucleofile și radicale pentru o moleculă.

Ce este nou în versiunea 2.2.0:

• bug-uri minore au fost stabilite
• Toate modificările geometrice pot fi anulate și refăcută cu ajutorul Undo și Redo (u / U sau Ctrl z / y Ctrl)
• Utilizatorul are un control complet asupra obligațiunilor afișate într-un desen.
• Desenul a atomului moleculei de atom au fost simplificate.
• Desenul a fragmentului moleculei de fragment au fost simplificate.
• Gabedit citit connectivities de gabedit, Hin, pdb, mol2 și fișierele mol.
• Utilizatorul poate seta valoarea distanței, unghiul de obligațiuni și unghiul diedru.
• O dinamică moleculară căutare conformațională este implementat cu ajutorul unui potențial MM (chihlimbar 99).
• O dinamica moleculara căutare conformațională este implementat folosind o metodă semi-empirice (de la Open Mopac sau PCGamess).
• Migrarea de la funcțiile de desen GDK la Cairo:. Cross-dispozitiv de redare pentru Vector Graphics
• Cairo este acum utilizat pentru widget-ul XYplot gabedit (utilizat de gabedit pentru spectre trage).
• Cairo este acum folosit pentru fereastra de desen geometrie.
• Geometry pot fi exportate în eps, ps, pdf sau svg fișier.
• Curbele de ferestre XYplot pot fi exportate în eps, ps, pdf sau svg fișier.
• New instrument de distanta de calcul între 2 puncte de pe fereastră XYPlot. & Quot; Control + buton shift & quot; poate fi folosit pentru a face un zoom in fereastra XYPlot.
• Cea mai nouă versiune de PCGamess (licurici) este acum suportat

Ce este nou în versiunea 2.1.13:

• bug-uri minore au fost fixe
• O dinamică moleculară căutare conformațională este implementat cu ajutorul unui potențial MM (chihlimbar 99).
• O dinamica moleculara căutare conformațională este implementat folosind un potential semi-empirice (folosind MOPAC sau PCGAMESS).
• Se poate optimiza geometria interactiv folosind metoda MOPAC sau PCGamess semi-empirice, din fereastra Egal Geometrie
• Migrarea de la funcțiile de desen GDK la Cairo: Cross-dispozitiv de redare pentru Vector Graphics. Cairo este folosit pentru widget-ul XYplot gabedit (utilizat de gabedit pentru spectre remiză). Cairo este folosit pentru fereastra de desen geometrie.
• Geometry pot fi exportate în eps, ps, pdf sau SVG fișier. Curbele de ferestre XYplot pot fi exportate în eps, ps, pdf sau svg fișier.
• New instrument de distanta de calcul între 2 puncte de pe fereastră XYPlot. & Quot; Control + butonul din stânga & quot; poate fi folosit pentru a face un zoom in fereastra XYPlot.
• Cea mai nouă versiune de PC Gamess / Firefly este acum suportat

Cerințe :

• GTK +