instrument de linie de comandă pentru compararea virgulă delimitat fișiere de date, folosind diferențele relative pentru a determina conformațiile mai similare. Compsort compară fișierele de date folosind diferență relativ, calculează un scor de similaritate, sortează scorurile în ordine crescătoare (valori mai mici reprezintă mai mare similitudine), salvează numărul X de scoruri mici.
Fișierele de date produse de către utilizator, trebuie virgulă fișiere text delimitate. Fiecare fișier reprezintă o moleculă unică. Fiecare rând într-un fișier reprezintă o conformație unică a moleculei. Prima coloană din fișierul de date trebuie să fie o etichetă unică de conformația reprezentat de rând. Restul coloanelor sunt descriptori numerice, cum ar fi spațiu măsurători la distanță.
Rândurile sunt comparate combinatorially între fișiere. Etichetele în comparație sunt concatenate și salvate cu scorurile pentru setul de rânduri. Aceasta oferă o modalitate de a identifica conformații care a produs un scor similitudine dat.
Lucru viitoare include:
- adăugând interfață GUI
- a posta hârtie pe algoritmul meu modelare 3D pharmacophore
- O versiune paralelă folosind MPI
Ce este nou în această versiune:
- un cuplu minor avertismente compilator fix
- adăugată raportarea de timp de calcul pentru set de calcule combinatorii în plus față de raportate anterior timp de sortare
- crescut nivelul de optimizare compilator de binar
Cerințe :
Mac OS X 10.3
Comentariile nu a fost găsit