CWC Simulator

Screenshot Software:
CWC Simulator
Detalii soft:
Versiune: 0.6
Incarca data: 11 May 15
Producător: Maurizio Drocco
Licenţă: Gratuit
Popularitate: 2

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

CWC Simulator este un C ++ implementarea CWC, un calcul pentru reprezentarea și simularea sistemelor biologice. & Nbsp; După o instalare reușită (consultați Instalarea) vei putea să ruleze simulari peste de modele CWC, așa cum se arată în câteva exemple (a se vedea exemplele /).
(Command-line) Interfata
Ca utilizator generic, ar trebui să rulați:

model.cwc -i
-o <> statistici
-t
-s
-n
-c
--qt prag
-q
-w
Unde:
- este numele executabil (implicit: scwc);
& Nbsp; - model.cwc este programul CWC intrare (vezi exemple);
& Nbsp; - statistici este prefixul de ieșire fișiere;
& Nbsp; - este limita de simulare de timp;
& Nbsp; - este perioada de eșantionare (de exemplu, 0,12 pentru a obține 250 de puncte, cu termen = 30);
& Nbsp; - este numărul de cazuri de simulare;
& Nbsp; - este numărul de clustere pentru k-mijloace
& Nbsp; - este pragul de QT clustering
& Nbsp; - este numărul de cuantile;
& Nbsp; - are, de obicei pentru a se potrivi numărul de nuclee ale sistemului (de exemplu, 4 pentru CPU quad-core).
Ieșire
Instrumentul produce:
- Unele fișiere DAT (ieșire eșantion de simulări)
- Unele script-uri gnuplot să atragă analysises statistice
Lucrăm la un manual de utilizare cuprinzător

Caracteristici :.

  • algoritm Gillespie SSA pe modele CWC
  • Hybrid stochastic / semantica deterministe
  • instanțe multiple ale simulării cu statistici online,
  • Optimizare pentru arhitecturi multicore bazat pe cadru FastFlow
  • cadru statistic Extensible (medie-varianță, filtrat clustering etc.)
  • semantică multiple de rating (acțiune în masă, Michaelis-Menten, Hill etc.)

Software similare

Genepidgin
Genepidgin

20 Feb 15

LSim
LSim

2 Jun 15

E-Cell System
E-Cell System

11 May 15

Comentarii la CWC Simulator

Comentariile nu a fost găsit
Adauga comentarii
Porniţi pe imagini!