CWC Simulator este un C ++ implementarea CWC, un calcul pentru reprezentarea și simularea sistemelor biologice. & Nbsp; După o instalare reușită (consultați Instalarea) vei putea să ruleze simulari peste de modele CWC, așa cum se arată în câteva exemple (a se vedea exemplele /).
(Command-line) Interfata strong>
Ca utilizator generic, ar trebui să rulați:
model.cwc -i
-o <> statistici
-t
-s
-n
-c
--qt prag
-q
-w
Unde:
-
& Nbsp; - model.cwc este programul CWC intrare (vezi exemple);
& Nbsp; - statistici este prefixul de ieșire fișiere;
& Nbsp; -
& Nbsp; -
& Nbsp; -
& Nbsp; -
& Nbsp; -
& Nbsp; -
& Nbsp; -
Ieșire
Instrumentul produce:
- Unele fișiere DAT (ieșire eșantion de simulări)
- Unele script-uri gnuplot să atragă analysises statistice
Lucrăm la un manual de utilizare cuprinzător
Caracteristici :.
- algoritm Gillespie SSA pe modele CWC
- Hybrid stochastic / semantica deterministe
- instanțe multiple ale simulării cu statistici online,
- Optimizare pentru arhitecturi multicore bazat pe cadru FastFlow
- cadru statistic Extensible (medie-varianță, filtrat clustering etc.)
- semantică multiple de rating (acțiune în masă, Michaelis-Menten, Hill etc.)
Comentariile nu a fost găsit