Seal este un modul Python care prevede alinierea secvență pe Hadoop.Seal este o aplicație de MapReduce de aliniere secvență biologic. Se rulează pe Hadoop (http://hadoop.apache.org) prin Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), un Python MapReduce și HDFS...
TRMiner este un utilitar Python care vizează curatori de date științifice. & Nbsp; permite să prune rapid colecții mari de publicații științifice la Exemple relevante pentru un scop minerit dat.Acest lucru se realizează în două etape. În primul rând,...
Pysam este un modul Python pentru citirea și manipularea Samfiles & nbsp;. E un înveliș ușor de samtools C-API.Ghidul de pornire rapidă este aici. Documentație Mai multe detalii găsiți aici.Întrebări și comentarii sunt foarte binevenite și ar trebui să...
PySCeS este un proiect dezvoltat de Triple-J Grupului pentru Molecular Cell Fiziologie. & Nbsp; pentru a încerca modelul și să înțeleagă procesele și sistemele complexe care alcătuiesc celula vie Caracteristici :. Un text bazat descriere model de...
goby este un API Python pentru citirea fișierelor de date binare create folosind cadrul de gestionare a datelor Goby next-gen.În mod normal, acest director vine ca parte a pachetului complet Goby, disponibil de la:& Nbsp; http:...
SSuMMo este o bibliotecă de funcții destinate în jurul iterativ folosind hmmer a atribui secvențe de taxoni & nbsp;. Rezultatele sunt copaci foarte adnotate arată specie / distribuție gen în acea comunitate.Programe incluse cu codul sursă includ unelte...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) este un program eficient care se aliniază secvențe nucleotidice relativ scurte împotriva o secvență de referință lung, cum ar fi genomului uman.Software-ul pune în aplicare doi algoritmi,-BWA scurt și BWA-SW. Foștii lucrările...
turba este o suită de programe pentru captarea, estimarea și analiza caracteristicilor biofizice de proteine.Vezi http://enzyme.ucd.ie/PEAT pentru documentare, instrucțiuni, capturi de ecran etc Cerințe :. ...
OpenElectrophy este un cadru care să faciliteze manipularea, depozitarea și analiza datelor electrofiziologice. Se poate importa date din mai multe formate de fișiere diferite și să le păstrați într-un singur bază de date de tip SQL.Instrumente de analiză...
(Obiecte Neural Ansamblul) NEO și este un proiect de a oferi un set comun de clase de bază pentru a fi utilizate în analiza datelor neuronale, cu scopul de a obține OpenElectrophy, NeuroTools și poate alte proiecte cu obiective similare mai aproape...
