CLC DNA Workbench

CLC ADN Workbench creează un mediu software care permite utilizatorilor de a face un număr mare de secvențe de ADN avansate analize, combinate cu managementul de date neted, și excelente grafice de vizualizare și de ieșire opțiuni.
CLC DNA Workbench este disponibil pe Windows, Mac OS X, și platforme Linux

Caracteristici :.

• Bioinformatica are în Gene Workbench :
• vizualizare flexibil de molecule circulare.
• Editor pentru proiectare grund avansate grafic și algoritmic
• Adunarea de date secventa ADN
• Clonarea moleculară
• automat SNP adnotare a secvențelor
• Căutare și descoperire a modelelor de ADN
• analizează regiune complexitatea Local
• Traducere Reverse de proteine ​​pentru a genei, pe baza tabelelor de traducere dintr-o serie de specii
• de analiză și de gestionare a enzimei de restricție avansata
• Dot analize bazate complot
• statisticile de ADN scurt formular, inclusiv o serie de caracteristici ale unui anumit molecule
• NCBI căutare de date secvență
• Accesul la info web de la PubMed
• Alte caracteristici bioinformatica:
• ADN, ARN și editor secvență de proteină sunt afișate atât liniare și molecule circulare
• ADN, ARN, si editor alinierea proteine ​​
• logo-uri interactive de-a lungul ambelor ADN, ARN și proteine ​​aliniamente
• prelucrarea lot de analize pe mai multe secvențe într-o singură lucrare pas
• Căutare Motif
• Pattern descoperire (modele necunoscute)
• Avansat re-aliniere și să stabilească puncte opțiune de aliniere
• grafice secvență logo-a lungul ADN-ului, ARN-ului, și aliniamente de proteine ​​
• adnotare manuală a secvențelor
• căutări PubMed integrat
• Web-based căutare secvență folosind BLAST
• Dot analize bazate complot
• regiune complexitate Local analize și parcele complexitate
• grafice fracțiune Gap
• G / C analiza de conținut și grafice
• Project și de gestionare a datelor:
• integrarea completă a datelor de intrare, de gestionare a datelor, rezultatele calculelor, și export de date
• detaliata log istorie
• Toate tipurile de fișiere pot fi salvate în proiecte locale, și a lansat de programul
• Import și export de date într-un număr mare de formate de fișiere
• Opțiune de a lucra în mai multe spații de lucru active la un moment dat, care să permită lucru simultan pe mai multe proiecte
• Import de fișiere de date urme și scorurile de calitate din masini sequening ADN automatizate folosind Standard Cromatograma Format, formate ABI și formatul PHD (Phred)
• Vizualizarea și raportarea:
• vedere BLAST avansata
• grafice avansate vizualiza
• vedere histogramă avansata
• Avansat vedere dot plot
• Caută caracteristici în secvențe și aliniamente

Cerințe :

• 256 MB RAM necesar
• 512 MB RAM recomandat
• 1024 x 768 de afișare recomandat

Limitări :

• demo 4 săptămâni complet funcțional