MetagenomeDB este o bibliotecă Python proiectat pentru a stoca cu ușurință, prelua și adnota secvențe metagenomic. & Nbsp; MetagenomeDB acționează ca un strat de abstractizare pe partea de sus a unei baze de date MongoDB. Acesta oferă un API pentru a crea...
SSuMMo este o bibliotecă de funcții destinate în jurul iterativ folosind hmmer a atribui secvențe de taxoni & nbsp;. Rezultatele sunt copaci foarte adnotate arată specie / distribuție gen în acea comunitate.Programe incluse cu codul sursă includ unelte...
tigreBrowser este o gena expresie browser model pentru rezultate din tigre pachet R (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Instalare: tigreBrowser necesită Python versiunea> = 2.5. tigreBrowser poate fi instalat cu următoarea...
MACS2 este un instrument de analiză pe baza modelului de date-Chip Seq.Odată cu îmbunătățirea tehnicilor de secvențiere, cromatinei imunoprecipitare urmată de secvențiere high-throughput (Chip-Seq) devine popular pentru a studia interactiunile de...
edittag este o colecție cerere pentru proiectarea seturi de editare tag-uri secventa metrice, verificarea tag-uri secventa de conformare a edita metrica, iar integrarea tag-uri secventa de adaptoare de secventiere specifice platformelor și primeri PCR....
MacMolPlt este un program de grafică modernă pentru trasarea structuri moleculare 3-D și modurile normale (vibrații). Mijloace...
picme este un pachet care conține programe Python pentru a estima și complot informativeness filogenetice pentru seturi de date de mari dimensiuni. Instalare Pentru moment, cel mai simplu mod de a instala programul este:git git clone:...
SyntenyMiner este o aplicație pentru a vizualiza și interogheze comparații între mai multe secvente genomului complet. Interfața oferă o vedere navigabil de meciuri cu o secvență a genomului de referință. Secvență meciuri între cromozomi diferite gene pot...
ProteinShop este un instrument interactiv pentru manipularea structurilor de proteine. Acesta a fost conceput pentru a crea rapid un set de configurații de proteine, folosind cunoașterea umană și intuiție. Aceste configurații pot fi supuse optimizare...
PySCeS este un proiect dezvoltat de Triple-J Grupului pentru Molecular Cell Fiziologie. & Nbsp; pentru a încerca modelul și să înțeleagă procesele și sistemele complexe care alcătuiesc celula vie Caracteristici :. Un text bazat descriere model de...
