LSim suprapune densitatea de electroni macromoleculare și calculează un scor de similaritate structurală. Calculele sale scară liniar cu mărimea moleculelor care sunt comparate.
Alinierile LSim sunt conceptual legătură cu elemente structurale biochimice și, prin urmare, sunt imparțiale și adecvate pentru studiile de similaritate proteine doar structura.
Instalare:
Despachetați fișierul de distribuție:
tar -xzvf lsim-linux.tar.gz
Mutare în directorul de fișiere:
cd lsim.1.0.0
Copia, muta sau link lsim fișier executabil într-o locație adecvată -și vă asigurați lsim este accesibil prin intermediul variabilă de mediu PATH, de exemplu:
cp lsim / usr / local / bin
Setați LSIMDIR variabilă pentru a indica la directorul LSim ales, de exemplu:
setenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0
Comentariile nu a fost găsit